Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BEND3Q5T5X7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BEND3Q5T5X7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BEND3Q5T5X7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms