Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN4Q56A73 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN4Q56A73 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPIN4Q56A73 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPIN4Q56A73 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPIN4Q56A73 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms