Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC38Q502W7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms