Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM187BQ17R55 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM187BQ17R55 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM187BQ17R55 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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