Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.33□□□□□ -2.362e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 RPL14-204ENST00000435633 966 ntTSL 221.27■■□□□ 12e-22■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.132e-22■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.432e-22■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 RPL14-208ENST00000479563 794 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.672e-22■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.342e-22■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 RPL14-209ENST00000481798 604 ntTSL 35.42□□□□□ -1.542e-22■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.133e-6■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.093e-6■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.733e-6■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 DEK-206ENST00000512145 791 ntTSL 56.78□□□□□ -1.323e-12■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 DEK-208ENST00000515770 730 ntTSL 55.39□□□□□ -1.552e-12■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 DEK-205ENST00000507591 739 ntTSL 24.96□□□□□ -1.622e-12■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-6■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SPAG9-219ENST00000514613 2523 ntTSL 26.4□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.045e-8■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.175e-8■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SRPK2-207ENST00000466917 2565 ntTSL 26.83□□□□□ -1.325e-8■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.575e-8■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SRPK2-213ENST00000485455 436 ntTSL 33.33□□□□□ -1.885e-8■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 218.8■□□□□ 0.66e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 317.6■□□□□ 0.416e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 316.93■□□□□ 0.36e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 416.52■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 310.3□□□□□ -0.766e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 49.83□□□□□ -0.846e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 49.76□□□□□ -0.856e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.866e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.156e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 MATR3-219ENST00000512040 642 ntTSL 34.47□□□□□ -1.695e-14■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 AP3D1-212ENST00000592488 707 ntTSL 316.62■□□□□ 0.257e-8■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-7■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 MYO6-205ENST00000430435 522 ntTSL 38.88□□□□□ -0.994e-6■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 MYO6-204ENST00000369985 8575 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.054e-6■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 MYO6-203ENST00000369981 8692 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.064e-6■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.274e-6■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.274e-6■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.344e-6■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.394e-6■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 NCOR1-223ENST00000583226 614 ntTSL 57.75□□□□□ -1.172e-8■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.228e-9■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 GOLGB1-208ENST00000494517 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)4.83□□□□□ -1.641e-6■■■■□ 20.8
TRA2AQ13595 BUB1B-202ENST00000412359 3628 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.216e-7■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.216e-7■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 BUB1B-209ENST00000559733 786 ntTSL 33.03□□□□□ -1.926e-7■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 BUB1B-210ENST00000559772 560 ntTSL 41.89□□□□□ -2.116e-7■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 HDLBP-202ENST00000373292 3297 ntTSL 510.08□□□□□ -0.82e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.822e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.062e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 HDLBP-226ENST00000453141 997 ntTSL 37.43□□□□□ -1.222e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 RBM39-215ENST00000442447 644 ntTSL 215.91■□□□□ 0.144e-15■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 RBM39-218ENST00000449489 432 ntTSL 57.43□□□□□ -1.224e-15■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 RBM39-211ENST00000426951 840 ntTSL 1 (best)3.63□□□□□ -1.834e-15■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.77e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 49.58□□□□□ -0.887e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 49.58□□□□□ -0.887e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 49.28□□□□□ -0.927e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 28.44□□□□□ -1.067e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.17e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 47.18□□□□□ -1.267e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 26.94□□□□□ -1.37e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 46.76□□□□□ -1.337e-9■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.664e-8■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.639e-8■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.689e-8■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.699e-8■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 STAMBP-205ENST00000424659 583 ntTSL 319.19■□□□□ 0.663e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 ITSN2-205ENST00000412011 2066 ntTSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.63e-8■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 STAMBP-206ENST00000432295 1156 ntTSL 517.02■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.313e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.453e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.453e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 STAMBP-211ENST00000536064 845 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 ZNF800-202ENST00000393312 2375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 STAMBP-207ENST00000452725 560 ntTSL 411.4□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NVL-201ENST00000281701 3123 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NVL-208ENST00000467882 1310 ntTSL 510.34□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.883e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NVL-211ENST00000469075 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.973e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 TAOK3-209ENST00000537952 2147 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.043e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NVL-216ENST00000482491 3003 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 NVL-202ENST00000340871 2431 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.073e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 TAOK3-212ENST00000540561 580 ntTSL 48.14□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 20.7
TRA2AQ13595 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 20.7
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 70.1 ms