Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXO1Q12778 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXO1Q12778 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXO1Q12778 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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