Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SATB1Q01826 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SATB1Q01826 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms