Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPCAP84074 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPCAP84074 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPCAP84074 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPCAP84074 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPCAP84074 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPCAP84074 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPCAP84074 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPCAP84074 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPCAP84074 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPCAP84074 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPCAP84074 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HPCAP84074 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPCAP84074 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPCAP84074 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPCAP84074 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPCAP84074 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPCAP84074 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPCAP84074 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HPCAP84074 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HPCAP84074 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPCAP84074 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPCAP84074 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPCAP84074 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPCAP84074 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPCAP84074 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPCAP84074 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms