Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERVK_113P63121 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms