Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS28P62857 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS28P62857 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS28P62857 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS28P62857 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS28P62857 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS28P62857 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS28P62857 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS28P62857 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS28P62857 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS28P62857 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS28P62857 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS28P62857 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS28P62857 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS28P62857 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS28P62857 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS28P62857 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS28P62857 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPS28P62857 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPS28P62857 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPS28P62857 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPS28P62857 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS28P62857 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS28P62857 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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