Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX1BP61266 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX1BP61266 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX1BP61266 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX1BP61266 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX1BP61266 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX1BP61266 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX1BP61266 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX1BP61266 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX1BP61266 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX1BP61266 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX1BP61266 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX1BP61266 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX1BP61266 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX1BP61266 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STX1BP61266 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX1BP61266 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX1BP61266 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX1BP61266 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX1BP61266 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX1BP61266 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX1BP61266 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX1BP61266 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX1BP61266 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX1BP61266 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX1BP61266 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX1BP61266 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX1BP61266 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX1BP61266 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX1BP61266 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX1BP61266 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STX1BP61266 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX1BP61266 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX1BP61266 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX1BP61266 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX1BP61266 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX1BP61266 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
STX1BP61266 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX1BP61266 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STX1BP61266 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX1BP61266 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX1BP61266 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX1BP61266 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX1BP61266 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX1BP61266 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STX1BP61266 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms