Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRLP54845 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRLP54845 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRLP54845 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRLP54845 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRLP54845 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRLP54845 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRLP54845 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRLP54845 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRLP54845 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRLP54845 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRLP54845 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRLP54845 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRLP54845 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRLP54845 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRLP54845 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRLP54845 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRLP54845 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRLP54845 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRLP54845 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NRLP54845 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRLP54845 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRLP54845 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NRLP54845 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRLP54845 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRLP54845 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRLP54845 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NRLP54845 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRLP54845 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRLP54845 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRLP54845 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRLP54845 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRLP54845 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRLP54845 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRLP54845 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRLP54845 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRLP54845 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRLP54845 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRLP54845 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRLP54845 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRLP54845 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRLP54845 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRLP54845 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRLP54845 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NRLP54845 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRLP54845 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRLP54845 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRLP54845 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NRLP54845 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NRLP54845 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRLP54845 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NRLP54845 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRLP54845 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRLP54845 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRLP54845 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms