Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTAP49354 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTAP49354 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTAP49354 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTAP49354 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTAP49354 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTAP49354 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTAP49354 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTAP49354 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTAP49354 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FNTAP49354 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTAP49354 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTAP49354 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTAP49354 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTAP49354 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTAP49354 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTAP49354 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTAP49354 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTAP49354 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FNTAP49354 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTAP49354 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTAP49354 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTAP49354 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTAP49354 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTAP49354 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTAP49354 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTAP49354 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTAP49354 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FNTAP49354 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNTAP49354 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNTAP49354 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNTAP49354 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FNTAP49354 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FNTAP49354 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTAP49354 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTAP49354 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTAP49354 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTAP49354 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTAP49354 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTAP49354 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTAP49354 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTAP49354 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTAP49354 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FNTAP49354 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTAP49354 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTAP49354 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTAP49354 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTAP49354 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTAP49354 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTAP49354 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTAP49354 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FNTAP49354 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FNTAP49354 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FNTAP49354 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FNTAP49354 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FNTAP49354 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTAP49354 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTAP49354 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTAP49354 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTAP49354 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTAP49354 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTAP49354 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FNTAP49354 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTAP49354 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTAP49354 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTAP49354 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTAP49354 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTAP49354 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTAP49354 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTAP49354 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTAP49354 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTAP49354 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FNTAP49354 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTAP49354 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTAP49354 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTAP49354 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTAP49354 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTAP49354 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTAP49354 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTAP49354 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTAP49354 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTAP49354 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FNTAP49354 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FNTAP49354 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms