Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms