Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6CP48668 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT6CP48668 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6CP48668 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6CP48668 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6CP48668 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6CP48668 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6CP48668 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6CP48668 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6CP48668 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms