Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN1BP46527 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms