Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH1P40925 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH1P40925 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH1P40925 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH1P40925 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDH1P40925 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDH1P40925 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDH1P40925 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDH1P40925 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDH1P40925 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDH1P40925 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDH1P40925 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDH1P40925 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDH1P40925 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MDH1P40925 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH1P40925 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH1P40925 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH1P40925 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH1P40925 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH1P40925 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH1P40925 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH1P40925 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MDH1P40925 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MDH1P40925 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH1P40925 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH1P40925 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH1P40925 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH1P40925 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH1P40925 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH1P40925 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH1P40925 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MDH1P40925 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MDH1P40925 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDH1P40925 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDH1P40925 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDH1P40925 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDH1P40925 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MDH1P40925 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MDH1P40925 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDH1P40925 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDH1P40925 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDH1P40925 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDH1P40925 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDH1P40925 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDH1P40925 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDH1P40925 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDH1P40925 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDH1P40925 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDH1P40925 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDH1P40925 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDH1P40925 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDH1P40925 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDH1P40925 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDH1P40925 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDH1P40925 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDH1P40925 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDH1P40925 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDH1P40925 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH1P40925 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH1P40925 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH1P40925 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH1P40925 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH1P40925 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH1P40925 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH1P40925 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDH1P40925 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDH1P40925 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms