Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP5C1P36542 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP5C1P36542 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms