Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX11P35716 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX11P35716 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX11P35716 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX11P35716 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX11P35716 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX11P35716 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX11P35716 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX11P35716 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX11P35716 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX11P35716 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX11P35716 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX11P35716 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX11P35716 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX11P35716 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX11P35716 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX11P35716 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX11P35716 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX11P35716 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX11P35716 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX11P35716 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX11P35716 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX11P35716 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX11P35716 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX11P35716 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX11P35716 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX11P35716 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX11P35716 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX11P35716 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX11P35716 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX11P35716 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX11P35716 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX11P35716 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX11P35716 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX11P35716 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX11P35716 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX11P35716 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX11P35716 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX11P35716 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX11P35716 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX11P35716 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX11P35716 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX11P35716 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX11P35716 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX11P35716 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX11P35716 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX11P35716 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX11P35716 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX11P35716 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX11P35716 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX11P35716 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX11P35716 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX11P35716 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX11P35716 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX11P35716 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX11P35716 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX11P35716 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX11P35716 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX11P35716 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX11P35716 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX11P35716 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX11P35716 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX11P35716 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX11P35716 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX11P35716 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX11P35716 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms