Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP214P35658 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP214P35658 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP214P35658 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP214P35658 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP214P35658 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP214P35658 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP214P35658 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP214P35658 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP214P35658 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP214P35658 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP214P35658 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP214P35658 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP214P35658 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP214P35658 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP214P35658 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP214P35658 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP214P35658 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP214P35658 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP214P35658 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP214P35658 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP214P35658 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP214P35658 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP214P35658 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP214P35658 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP214P35658 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP214P35658 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP214P35658 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP214P35658 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP214P35658 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP214P35658 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP214P35658 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP214P35658 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP214P35658 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP214P35658 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP214P35658 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP214P35658 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP214P35658 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP214P35658 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP214P35658 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP214P35658 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP214P35658 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP214P35658 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP214P35658 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP214P35658 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP214P35658 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms