Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PSMB9P28065 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PSMB9P28065 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms