Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCN1P20061 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TCN1P20061 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCN1P20061 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCN1P20061 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCN1P20061 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCN1P20061 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCN1P20061 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCN1P20061 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TCN1P20061 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TCN1P20061 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCN1P20061 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCN1P20061 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCN1P20061 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCN1P20061 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCN1P20061 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCN1P20061 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCN1P20061 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TCN1P20061 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCN1P20061 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCN1P20061 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCN1P20061 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCN1P20061 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCN1P20061 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCN1P20061 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCN1P20061 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TCN1P20061 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCN1P20061 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCN1P20061 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCN1P20061 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCN1P20061 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCN1P20061 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCN1P20061 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCN1P20061 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCN1P20061 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCN1P20061 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCN1P20061 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCN1P20061 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCN1P20061 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCN1P20061 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCN1P20061 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCN1P20061 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCN1P20061 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms