Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TCP1P17987 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCP1P17987 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCP1P17987 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCP1P17987 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCP1P17987 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCP1P17987 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCP1P17987 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TCP1P17987 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCP1P17987 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCP1P17987 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCP1P17987 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCP1P17987 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCP1P17987 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCP1P17987 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCP1P17987 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCP1P17987 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCP1P17987 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCP1P17987 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCP1P17987 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCP1P17987 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCP1P17987 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCP1P17987 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCP1P17987 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCP1P17987 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCP1P17987 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCP1P17987 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCP1P17987 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCP1P17987 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCP1P17987 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCP1P17987 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCP1P17987 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCP1P17987 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCP1P17987 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCP1P17987 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCP1P17987 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCP1P17987 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCP1P17987 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCP1P17987 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCP1P17987 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCP1P17987 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCP1P17987 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCP1P17987 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCP1P17987 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCP1P17987 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms