Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GM2AP17900 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GM2AP17900 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GM2AP17900 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GM2AP17900 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GM2AP17900 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GM2AP17900 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GM2AP17900 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GM2AP17900 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GM2AP17900 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GM2AP17900 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GM2AP17900 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GM2AP17900 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GM2AP17900 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GM2AP17900 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GM2AP17900 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GM2AP17900 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GM2AP17900 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GM2AP17900 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GM2AP17900 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GM2AP17900 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GM2AP17900 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GM2AP17900 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GM2AP17900 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GM2AP17900 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GM2AP17900 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GM2AP17900 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GM2AP17900 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GM2AP17900 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GM2AP17900 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GM2AP17900 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GM2AP17900 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GM2AP17900 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GM2AP17900 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GM2AP17900 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GM2AP17900 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GM2AP17900 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GM2AP17900 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GM2AP17900 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GM2AP17900 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GM2AP17900 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GM2AP17900 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GM2AP17900 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GM2AP17900 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GM2AP17900 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GM2AP17900 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GM2AP17900 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GM2AP17900 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GM2AP17900 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GM2AP17900 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GM2AP17900 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GM2AP17900 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GM2AP17900 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GM2AP17900 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms