Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB9P17482 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXB9P17482 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB9P17482 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms