Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA3P15088 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPA3P15088 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPA3P15088 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPA3P15088 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA3P15088 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA3P15088 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA3P15088 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA3P15088 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA3P15088 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA3P15088 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA3P15088 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA3P15088 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA3P15088 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPA3P15088 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPA3P15088 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA3P15088 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA3P15088 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPA3P15088 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA3P15088 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA3P15088 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA3P15088 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA3P15088 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA3P15088 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA3P15088 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA3P15088 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA3P15088 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA3P15088 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPA3P15088 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA3P15088 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA3P15088 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA3P15088 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA3P15088 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA3P15088 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA3P15088 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA3P15088 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA3P15088 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPA3P15088 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPA3P15088 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA3P15088 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA3P15088 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA3P15088 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA3P15088 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA3P15088 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA3P15088 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA3P15088 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA3P15088 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA3P15088 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA3P15088 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms