Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV3-30-5P0DP03 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV3-30-5P0DP03 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms