Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPSAP08865 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPSAP08865 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPSAP08865 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPSAP08865 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPSAP08865 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPSAP08865 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPSAP08865 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPSAP08865 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPSAP08865 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPSAP08865 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPSAP08865 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPSAP08865 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPSAP08865 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPSAP08865 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPSAP08865 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPSAP08865 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPSAP08865 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPSAP08865 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPSAP08865 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPSAP08865 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPSAP08865 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPSAP08865 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPSAP08865 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPSAP08865 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPSAP08865 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPSAP08865 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPSAP08865 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPSAP08865 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPSAP08865 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPSAP08865 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPSAP08865 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPSAP08865 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPSAP08865 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPSAP08865 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPSAP08865 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPSAP08865 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPSAP08865 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPSAP08865 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPSAP08865 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPSAP08865 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPSAP08865 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPSAP08865 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPSAP08865 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPSAP08865 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPSAP08865 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPSAP08865 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPSAP08865 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPSAP08865 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPSAP08865 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPSAP08865 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPSAP08865 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPSAP08865 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms