Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDN1P05305 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDN1P05305 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDN1P05305 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDN1P05305 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDN1P05305 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDN1P05305 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDN1P05305 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDN1P05305 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDN1P05305 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDN1P05305 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDN1P05305 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDN1P05305 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDN1P05305 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDN1P05305 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDN1P05305 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDN1P05305 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDN1P05305 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDN1P05305 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDN1P05305 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDN1P05305 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EDN1P05305 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDN1P05305 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDN1P05305 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDN1P05305 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDN1P05305 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDN1P05305 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDN1P05305 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDN1P05305 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDN1P05305 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDN1P05305 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDN1P05305 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDN1P05305 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDN1P05305 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDN1P05305 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDN1P05305 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDN1P05305 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDN1P05305 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDN1P05305 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDN1P05305 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDN1P05305 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDN1P05305 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDN1P05305 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDN1P05305 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EDN1P05305 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDN1P05305 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDN1P05305 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDN1P05305 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDN1P05305 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDN1P05305 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDN1P05305 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDN1P05305 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDN1P05305 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EDN1P05305 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EDN1P05305 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDN1P05305 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EDN1P05305 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EDN1P05305 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EDN1P05305 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EDN1P05305 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDN1P05305 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDN1P05305 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDN1P05305 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDN1P05305 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms