Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT6BP04259 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT6BP04259 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT6BP04259 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms