Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OPN1SWP03999 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OPN1SWP03999 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OPN1SWP03999 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OPN1SWP03999 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OPN1SWP03999 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN1SWP03999 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
OPN1SWP03999 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OPN1SWP03999 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN1SWP03999 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OPN1SWP03999 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1SWP03999 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1SWP03999 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1SWP03999 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1SWP03999 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1SWP03999 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OPN1SWP03999 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1SWP03999 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1SWP03999 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OPN1SWP03999 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OPN1SWP03999 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OPN1SWP03999 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN1SWP03999 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN1SWP03999 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OPN1SWP03999 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN1SWP03999 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN1SWP03999 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN1SWP03999 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN1SWP03999 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OPN1SWP03999 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OPN1SWP03999 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
OPN1SWP03999 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms