Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MT-ND3P03897 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ND3P03897 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms