Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC3P02656 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC3P02656 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC3P02656 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC3P02656 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC3P02656 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC3P02656 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC3P02656 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC3P02656 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC3P02656 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC3P02656 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC3P02656 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC3P02656 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC3P02656 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC3P02656 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC3P02656 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC3P02656 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC3P02656 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC3P02656 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC3P02656 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC3P02656 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC3P02656 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC3P02656 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC3P02656 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC3P02656 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC3P02656 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC3P02656 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC3P02656 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC3P02656 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOC3P02656 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOC3P02656 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOC3P02656 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC3P02656 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC3P02656 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms