Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPNE6O95741 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE6O95741 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms