Protein–RNA interactions for Protein: O76071

CIAO1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIAO1O76071 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CIAO1O76071 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CIAO1O76071 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CIAO1O76071 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CIAO1O76071 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIAO1O76071 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms