Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL41O60662 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL41O60662 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL41O60662 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms