Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACOX3O15254 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACOX3O15254 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACOX3O15254 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACOX3O15254 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACOX3O15254 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACOX3O15254 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACOX3O15254 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACOX3O15254 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACOX3O15254 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACOX3O15254 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACOX3O15254 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACOX3O15254 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms