Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GIPC1O14908 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIPC1O14908 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms