Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4O00268 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4O00268 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4O00268 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4O00268 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4O00268 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4O00268 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4O00268 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4O00268 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4O00268 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF4O00268 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4O00268 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4O00268 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4O00268 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4O00268 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4O00268 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4O00268 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4O00268 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4O00268 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4O00268 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF4O00268 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF4O00268 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF4O00268 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4O00268 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4O00268 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4O00268 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4O00268 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4O00268 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF4O00268 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4O00268 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4O00268 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4O00268 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4O00268 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4O00268 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4O00268 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4O00268 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF4O00268 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4O00268 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4O00268 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4O00268 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4O00268 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4O00268 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4O00268 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF4O00268 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4O00268 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4O00268 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4O00268 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4O00268 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4O00268 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4O00268 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF4O00268 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF4O00268 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TAF4O00268 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TAF4O00268 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF4O00268 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms