Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GOLGA8SH3BPF8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA8SH3BPF8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA8SH3BPF8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms