Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6L3A6NEY3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6L3A6NEY3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6L3A6NEY3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms