Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TSPAN11A1L157 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN11A1L157 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN11A1L157 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms