Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRGMA1A4Y4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRGMA1A4Y4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms