Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D4Q7Z3S7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms