Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD40Q6AI12 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms