Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTC1Q2NKJ3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms