Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM53BQ14153 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms