Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms