Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GDF10P55107 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GDF10P55107 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GDF10P55107 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms