Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms